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Cytogenetic Resource of FISH-mapped, Sequence-tagged Clones


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Chr clone name Distributor1 FISH Placement on genome2 Placement summary3 Insert sequence4 STS4 BAC-ends4 Flag
8 CTB-77L23 8pter(UChicago)
chr8 1Mb   D8S504    
8 CTB-9B23 R 8p23.3(CSMC)
chr8 3Mb   D8S262    
8 RP11-82K8 C 8p23.3(FHCRC)
chr8 2Mb   SHGC-11993    
8 RP11-246G24 C 8p23.2~23.3(FHCRC)
chr8 2Mb     AQ478265.1 SP6,
AQ478268.1*u T7
 
8 CTD-2154J19 8p23(FHCRC)
chr10 3Mb     AQ729522.1 SP6,
AQ729340.1 T7
 
8 RP11-143D15 C 8p23(FHCRC)
chr8 6Mb AC011835.8 AA125872 AQ371820.1 T7,
AQ371819.1 SP6
 
8 RP11-279J6 C 8p23(FHCRC)
chr8 29Mb   SHGC-16001, SHGC-14694 AQ508044.1 SP6,
AQ508045.1 T7
 
8 RP11-451M4 C 8p23(FHCRC)
chr8 5Mb     AQ584043.1 SP6,
AQ584047.1 T7
 
8 RP11-45M12 C 8p23(FHCRC)
chr8 3Mb AC009428.4   AQ194413.1 ,
AQ194415.1
 
8 RP11-79I19 C 8p23(FHCRC)
chr8 3Mb AC084222.6   AQ283728.1 T7,
AZ519068.1 SP6,
AQ317568.1 SP6
 
8 RP11-86A14 C 8p23(FHCRC)
chr8 0Mb AC018869.4,
AC091692.6
     
8 RP11-91J19 C 8p23(FHCRC)
chr8 0Mb AC083964.3   AQ283567.1 SP6,
AQ283570.1 T7
 
8 RP11-235O5 C 8p22~23(FHCRC)
chr8 10Mb   SHGC-1941 AQ486011.1 T7  
8 RP11-277K10 C 8p22~23(FHCRC)
chr8 9Mb   SHGC-24414    
8 RP11-287P18 C 8p22~23(FHCRC)
chr8 7Mb AC130360.4 SHGC-12200    
8 RP11-113B7 C 8p23.2(FHCRC)
chr8 4Mb   SHGC-1370, SHGC-10646 AQ341808.1 T7,
AQ341807.1 SP6
 
8 RP11-121F7 C 8p23.2(FHCRC)
chr8 85Mb   SHGC-20468*d AQ350961.1 T7,
AQ350960.1*d SP6
multiple_placements_on_genome
8 RP11-121F7 C 8p23.2(FHCRC)
chr8 3Mb   SHGC-20468 AQ350960.1 SP6,
AQ350961.1*d T7
multiple_placements_on_genome
8 RP11-140K14 C 8p23.2(FHCRC)
chr8 4Mb   SHGC-10646 AQ386725.1 T7,
AQ386711.1 SP6
 
8 RP11-240A17 C 8p23.2(FHCRC)
chr8 1Mb   SHGC-2740    
8 RP11-89I12 C 8p23.2(FHCRC)
chr8 4Mb AC084705.4   AQ282892.1 T7,
AQ282890.1 SP6
 
8 CTA-391D12 R 8p23.2~23.1(CSMC)
chr8 10Mb   AFMA216ZB1    
8 RP11-11P7 R 8p23.2c(NCI)
chr8 2Mb AC019274.5   B74941.1 T7,
B74940.1 SP6
 
8 CTB-66A22 R 8p23.1(CSMC)
chr8 10Mb   AFMA216ZB1    
8 RP11-235F10 C 8p23.1(FHCRC)
chr8 9Mb   SHGC-1925 AQ491571.1 T7,
AQ491569.1 SP6
 
8 RP11-235I5 CR 8p23.1(FHCRC)
8p23.1a(NCI)
chr8 11Mb AC090790.4 SHGC-33472 AQ485960.1 T7,
AQ485959.1 SP6
 
8 RP11-241I4 C 8p23.1(FHCRC)
chr8 10Mb   SHGC-17264 AQ485087.1 T7,
AQ485085.1 SP6
 
8 RP11-252K12 C 8p23.1(FHCRC)
chr8 10Mb   SHGC-1962 AZ517461.1 SP6,
AQ491832.1 T7
 
8 RP11-80B8 C 8p23.1(FHCRC)
chr8 11Mb   SHGC-33472 AQ283234.1 T7,
AQ283231.1 SP6
 
8 RP11-122N11 C 8p22~23.1(FHCRC)
chr8 7Mb   SHGC-12200, SHGC-11992   multiple_placements_on_genome
8 RP11-122N11 C 8p22~23.1(FHCRC)
chr8 7Mb   SHGC-11992, SHGC-12200   multiple_placements_on_genome
8 RP11-254E10 C 8p22~23.1(FHCRC)
chr8 11Mb   SHGC-3114    
8 RP11-31B7 C 8p22~23.1(FHCRC)
chr8 12Mb   SHGC-1964 AQ046036.1 ,
AQ015042.1*u SP6
 
8 RP11-92C1 C 8p22~23.1(FHCRC)
chr8 12Mb   SHGC-4497 AQ318792.1 SP6  
8 CTD-2015D3 R 8p22(UCSF)
chr8 26Mb     B54151.1 SP6,
AQ226511.1 SP6,
B65002.1 ,
AQ236188.1 T7
 
8 RP11-112G9 C 8p22(FHCRC)
chr8 10Mb   SHGC-1955 AQ342701.1 T7,
AQ323784.1 SP6
 
8 RP11-141K9 C 8p22(FHCRC)
chr8 17Mb AC084079.2 R26163 AQ385195.1 T7,
AQ385193.1 SP6
 
8 RP11-182G2 C 8p22(FHCRC)
chr8 15Mb   SHGC-1961    
8 RP11-218N24 C 8p22(FHCRC)
chr8 11Mb   SHGC-11994    
8 RP11-236O1 C 8p22(FHCRC)
chr8 15Mb   SHGC-34298    
8 RP11-262B15 C 8p22(FHCRC)
chr8 9Mb   SHGC-14496 AQ490585.1 T7  
8 RP11-274K12 C 8p22(FHCRC)
chr8 16Mb   SHGC-12479 AQ480814.1 T7  
8 RP11-353K12 C 8p22(FHCRC)
chr8 20Mb AC025853.17   AQ533583.1 T7,
AQ533581.1 SP6
 
8 RP11-525O22 C 8p22(FHCRC)
chr8 17Mb AC034166.4,
AC087625.12
     
8 RP11-89M16 R 8p22(FHCRC)
8p22a(NCI)
chr8 17Mb AC015807.5*d   AZ517262.1 T7,
AQ283418.1 T7,
AQ283415.1 SP6
multiple_placements_on_genome
8 RP11-89M16 R 8p22(FHCRC)
8p22a(NCI)
chr8 129Mb AC015807.5   AQ283415.1*d SP6,
AQ283418.1*d T7,
AZ517262.1*d T7
multiple_placements_on_genome
8 RP11-89O4 C 8p22(FHCRC)
chr8 20Mb AC087619.4   AQ283535.1 T7,
AZ517692.1 SP6,
AQ283532.1 SP6
 
8 RP11-90I3 C 8p22(FHCRC)
chr8 16Mb     AQ281652.1 T7,
AQ281649.1 SP6
 
8 RP11-90J21 C 8p22(FHCRC)
chr8 8Mb AC083927.4   AQ284379.1 SP6,
AZ518549.1 T7,
AQ284381.1 T7
 
8 RP11-90O17 C 8p22(FHCRC)
chr8 12Mb AC083925.2*u   AQ285551.1 T7,
BZ089436.1 ,
BZ089432.1 ,
AQ285548.1 SP6
 
8 RP11-93D21 C 8p21.3~22(FHCRC)
chr8 20Mb   SHGC-720 AQ282073.1 SP6  
8 RP11-233H21 C 8p21~22(FHCRC)
chr8 19Mb   SHGC-35965, SHGC-36691    
8 RP11-79E11 C 8p21~22(FHCRC)
chr8 9Mb     AQ282493.1 T7,
AZ520711.1 SP6,
AQ282491.1 SP6
 
8 RP11-23H1 R 8p22c(NCI)
chr8 15Mb AC020992.10   AQ013789.1 ,
AQ013787.1
 
8 RP11-468H14 R 8p22b(NCI)
chr8 16Mb AC079193.10   AQ637600.1 SP6,
AQ637602.1 T7
 
8 RP11-108E14 R 8p21.3c~21.3b(NCI)
chr8 20Mb AC018541.7   AQ318454.1 SP6,
AQ318633.1 T7
 
8 RP11-110I16 C 8p21.3(FHCRC)
chr8 21Mb AC105178.1*u SHGC-31819 AQ323919.1 T7,
AQ350174.1*u SP6
 
8 RP11-191P9 C 8p21.3(FHCRC)
chr8 19Mb   SHGC-33536, SHGC-35965 AQ413269.1 SP6,
AZ516678.1*u SP6
 
8 RP11-204M16 C 8p21.3(FHCRC)
chr8 23Mb   SHGC-32556 AQ417174.1 SP6,
AQ417176.1 T7
 
8 RP11-50E20 C 8p21.3(FHCRC)
chr8 21Mb   SHGC-5242 AQ053425.1 ,
AQ053428.1
 
8 RP11-51C1 C 8p21.3(FHCRC)
chr8 19Mb   SHGC-33765 AQ052279.1  
8 CTA-399G8 R 8p21(CSMC)
chr8 20Mb   D8S280    
8 CTB-15N20 R 8p21(CSMC)
chr8 21Mb   D8S560    
8 RP11-134G10 C 8p21(FHCRC)
chr8 29Mb     AQ386875.1 T7,
AQ344404.1*u SP6
 
8 RP11-138J2 CR 8p21(FHCRC)
8p21.2a(NCI)
chr8 27Mb AC010856.12 SHGC-35790 AQ384966.1 SP6,
AQ349046.1 T7
 
8 RP11-288N10 C 8p21(FHCRC)
chr8 23Mb   SHGC-33931    
8 RP11-459E5 C 8p21(FHCRC)
chr8 22Mb AC055854.14   AQ585469.1 T7  
8 RP11-722A15 C 8p21(FHCRC)
chr8 26Mb AC022911.6   AQ462161.1 T7,
AQ513457.1 SP6
 
8 RP11-89M8 C 8p21(FHCRC)
chr8 22Mb AC084081.6 AA453410 AQ283395.1 T7  
8 RP11-280G1 C 8p12~21(FHCRC)
chr4 185Mb   SHGC-24783 AQ508863.1 T7,
AQ508861.1*u SP6
 
8 RP11-662B19 CR 8p12~21(FHCRC)
8p21.1c(NCI)
chr8 28Mb AC040975.8   AQ496232.1 T7,
AQ434593.1 SP6
 
8 RP11-799H21 C 8p12~21(FHCRC)
chr8 29Mb AC055851.3   AQ556279.1 T7  
8 RP11-158F9 C 8p21.2(FHCRC)
chr8 24Mb   SHGC-20480 AQ372764.1 SP6  
8 RP11-164H24 C 8p21.2(FHCRC)
chr8 25Mb   SHGC-36250 AQ380969.1 SP6  
8 RP11-199N14 C 8p21.2(FHCRC)
chr8 26Mb   SHGC-13613 AQ412627.1 SP6  
8 RP11-274M9 C 8p21.2(FHCRC)
chr8 22Mb   SHGC-36225 AZ518716.1 T7,
AQ508974.1 SP6
 
8 RP11-70L1 C 8p21.2(FHCRC)
chr8 25Mb   SHGC-31262, SHGC-10738, SHGC-36250, SHGC-10962*d AQ237512.1 SP6 multiple_placements_on_genome
8 RP11-70L1 C 8p21.2(FHCRC)
chr8 26Mb   SHGC-10962, SHGC-36250*d, SHGC-10738*d, SHGC-31262*d AQ237512.1*d SP6 multiple_placements_on_genome
8 RP11-76B12 C 8p21.2(FHCRC)
chr8 25Mb   SHGC-31262 AQ281843.1 SP6  
8 RP11-90M13 C 8p21.2(FHCRC)
chr8 25Mb AC084080.3   AQ283761.1 T7  
8 RP11-219J21 R 8p21.2b(NCI)
chr8 25Mb AC009623.6      
8 RP11-116F9 C 8p12~21.1(FHCRC)
chr8 28Mb   SHGC-10443 AQ345366.1 SP6  
8 RP11-5J20 C 8p12~21.1(FHCRC)
chr8 29Mb   SHGC-33982 AZ516958.1 SP6,
B69667.1 T7,
B49252.1 T7
 
8 CTB-21P17 R 8p12(CSMC)
chr8 22Mb   AFMB055ZA9    
8 CTD-2014P5 R 8p12(UCSF)
chr8 38Mb     B54140.1 SP6  
8 CTD-2020E14 C 8p12(FHCRC)
chr8 31Mb     AQ228723.1 T7  
8 CTD-2060N3 C 8p12(FHCRC)
chr8 32Mb     B70009.1 SP6,
AQ243354.1 SP6,
B70805.1 ,
AQ245751.1 T7
 
8 CTD-2285C17 R 8p12(UCSF)
chr8 42Mb     AQ009645.1  
8 RP11-1002K11 C 8p12(FHCRC)
chr8 32Mb AC113209.4   AQ594898.1 SP6,
AQ714438.1*u T7
 
8 RP11-122D17 C 8p12(FHCRC)
chr8 32Mb AC114590.1*u SHGC-12780 AQ343570.1 T7,
AQ383764.1 SP6
 
8 RP11-139G9 C 8p12(FHCRC)
chr8 31Mb AC140512.1*u SHGC-37564 AQ385684.1 T7  
8 RP11-173D10 C 8p12(FHCRC)
chr8 30Mb     AQ416588.1 SP6  
8 RP11-210F15 C 8p12(FHCRC)
chr8 36Mb   SHGC-20486    
8 RP11-232J22 C 8p12(FHCRC)
chr8 26Mb   SHGC-36722 AQ485011.1 SP6  
8 RP11-258M15 C 8p12(FHCRC)
chr8 33Mb   SHGC-1934 AQ483713.1 T7,
AQ483709.1 SP6
 
8 RP11-263C6 C 8p12(FHCRC)
chr8 28Mb AC024064.4, AC090143.4*u      
8 RP11-265K5 C 8p12(FHCRC)
chr8 38Mb   SHGC-37155 AQ489857.1 T7,
AQ489855.1 SP6
 
8 RP11-274F14 C 8p12(FHCRC)
chr8 35Mb   SHGC-6153    
8 RP11-275K7 C 8p12(FHCRC)
chr8 28Mb   SHGC-15326    
8 RP11-277I21 C 8p12(FHCRC)
chr8 28Mb   SHGC-3342    
Chr clone name Distributor1 FISH Placement on genome2 Placement summary3 Insert sequence4 STS4 BAC-ends4 Flag
8 RP11-287N19 C 8p12(FHCRC)
chr8 30Mb   SHGC-12373    
8 RP11-363L24 C 8p12(FHCRC)
chr8 31Mb AC009563.12      
8 RP11-380I10 C 8p12(FHCRC)
chr8 28Mb AC021678.13   AQ535165.1 SP6  
8 RP11-451O18 C 8p12(FHCRC)
chr8 33Mb AC104027.4   AQ584159.1 T7  
8 RP11-57I3 C 8p12(FHCRC)
chr8 32Mb   SHGC-894 AQ082612.1 ,
AQ115482.1
 
8 RP11-60N24 C 8p12(FHCRC)
chr8 30Mb     AQ199896.1 ,
AQ199892.1
 
8 RP11-79H13 C 8p12(FHCRC)
chr8 34Mb AC090929.2,
AF306443.5
  AQ284240.1 T7,
AQ284226.1 SP6
 
8 RP11-89G22 8p12(FHCRC)
chr8 36Mb AC090809.9   AQ282854.1 SP6,
AQ282856.1 T7
 
8 RP11-89N2 C 8p12(FHCRC)
chr8 29Mb     AQ286621.1 T7,
AQ286619.1*u SP6
 
8 RP11-91A19 8p12(FHCRC)
chr8 34Mb AC083963.6   AZ518689.1 T7,
AQ286326.1 T7,
AQ286324.1 SP6
 
8 RP11-91P13 C 8p12(FHCRC)
chr8 33Mb     AQ284274.1 SP6,
AQ284277.1 T7
 
8 RP11-100B16 C 8p11.2~12(FHCRC)
chr8 38Mb   SHGC-11130 AQ345472.1 SP6,
AQ323336.1 T7
 
8 RP11-113G10 C 8p11.2~12(FHCRC)
chr8 37Mb     AQ372463.1 SP6,
AQ341394.1 T7
 
8 RP11-237M13 C 8p11.2~12(FHCRC)
chr8 35Mb   SHGC-4695 AQ485902.1 SP6,
AQ485905.1 T7
 
8 RP11-333B24 C 8p11.2~12(FHCRC)
chr8 38Mb AC026327.10,
AC090129.3
     
8 RP11-89M20 C 8p11.2~12(FHCRC)
chr8 35Mb AC124290.5   AQ283517.1 T7,
AZ517683.1 SP6,
AQ283514.1 SP6
 
8 RP11-2I13 R 8p12c(NCI)
chr8 33Mb AC015779.8   B48555.1 T7,
B48554.1 SP6
 
8 CTB-18G23 R 8p11.2(CSMC)
chr8 35Mb   AFMA192XD5    
8 CTB-22K20 R 8p11.2(CSMC)
chr8 37Mb   AFMA219ZG9    
8 CTB-3H23 R 8p11.2(CSMC)
chr8 33Mb   D8S1758    
8 RP11-133O7 C 8p11.2(FHCRC)
chr8 39Mb   SHGC-649 AZ521463.1 SP6,
AQ384437.1*u T7
 
8 RP11-213C20 C 8p11.2(FHCRC)
chr8 42Mb   SHGC-6186, SHGC-37178, SHGC-37178*u AQ484364.1 SP6,
AQ484365.1 T7
 
8 RP11-262I23 C 8p11.2(FHCRC)
chr8 39Mb   SHGC-12674 AQ488736.1 SP6,
AQ488737.1 T7
 
8 RP11-264K12 C 8p11.2(FHCRC)
chr8 61Mb   SHGC-12703 AQ486486.1 SP6,
AQ486487.1 T7
 
8 RP11-282J24 C 8p11.2(FHCRC)
chr8 41Mb   SHGC-13448    
8 RP11-284J3 C 8p11.2(FHCRC)
chr8 40Mb   SHGC-18041    
8 RP11-48D21 C 8p11.2(FHCRC)
chr8 40Mb   SHGC-5765 AQ199448.1 ,
AQ199451.1
 
8 RP11-513D5 C 8p11.2(FHCRC)
chr8 38Mb AC024242.3,
AC087362.13
     
8 RP11-675F6 C 8p11.2(FHCRC)
chr8 38Mb AC069120.9      
8 RP11-89A4 C 8p11.2(FHCRC)
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AQ202482.1
 
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B71896.1 SP6
 
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AQ321884.1 T7
 
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AQ347268.1 SP6
 
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AQ350584.1 SP6
 
8 RP11-15K1 C 8q21.1(FHCRC)
chr8 80Mb AC021482.10   B82425.1 T7  
8 RP11-203C23 C 8q21.1(FHCRC)
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8 RP11-214E11 C 8q21.1(FHCRC)
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8 RP11-225J6 C 8q21.1(FHCRC)
chr8 75Mb   SHGC-1960    
Chr clone name Distributor1 FISH Placement on genome2 Placement summary3 Insert sequence4 STS4 BAC-ends4 Flag
8 RP11-24L2 C 8q21.1(FHCRC)
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8 RP11-24L2 C 8q21.1(FHCRC)
chr8 74Mb AC013650.8*d SHGC-35192   multiple_placements_on_genome
8 RP11-523D2 C 8q21.1(FHCRC)
chr8 79Mb AC023138.5, AC090892.1*u      
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AF305874.2
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AQ199306.1
 
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AQ198472.1
 
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8 RP11-80P18 C 8q21.3(FHCRC)
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8 RP11-88J22 C 8q21.3~22(FHCRC)
chr8 94Mb AC022825.9   AQ281024.1 SP6,
AZ516289.1 T7,
AQ281026.1 T7
 
8 RP11-90N3 C 8q21.3~22(FHCRC)
chr8 96Mb     AQ284531.1 T7,
AQ284530.1 SP6
 
8 RP11-91G3 C 8q21.3~22(FHCRC)
chr8 91Mb AC084435.2*u   AQ281348.1 SP6,
AQ281360.1 T7
 
8 CTA-737G7 R 8q22.1(CSMC)
chr8 90Mb   D8S1605    
8 CTB-48H15 R 8q22.1~22.2(CSMC)
chr8 100Mb   SHGC-20503    
8 CTB-51A4 R 8q22(CSMC)
chr8 103Mb   AFM192XC5, AFMA073ZG5, AFM192XC5*u    
8 RP11-125O21 C 8q22(FHCRC)
chr8 99Mb   SHGC-216, SHGC-216*u AQ347567.1 T7,
AQ347565.1 SP6
 
8 RP11-127B4 C 8q22(FHCRC)
chr8 55Mb   SHGC-5796    
8 RP11-12K18 C 8q22(FHCRC)
chr8 103Mb AC011777.9   B75870.1 SP6,
B75871.1 T7
 
8 RP11-131O16 C 8q22(FHCRC)
chr8 99Mb   SHGC-36779    
8 RP11-136H10 C 8q22(FHCRC)
chr8 100Mb   SHGC-18044 AQ346939.1 T7,
AQ383897.1 SP6
 
8 RP11-208E21 C 8q22(FHCRC)
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8 RP11-238H10 C 8q22(FHCRC)
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chr8 97Mb AC079106.2   AQ551766.1 T7,
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8 RP11-680G2 C 8q22(FHCRC)
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AC091075.2
  AQ610751.1 SP6  
8 RP11-79C18 C 8q22(FHCRC)
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AQ008878.1 T7,
B86257.1 T7
 
8 RP11-662P7 R 8q22.1d(NCI)
chr8 98Mb AC023073.4   AQ496302.1 T7,
AQ434670.1 SP6
 
8 RP11-102K7 C 8q22.2(FHCRC)
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8q22.2b(NCI)
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chr8 100Mb   SHGC-20503, SHGC-5238, SHGC-37498*u AQ387400.1 T7,
AQ387396.1 SP6
 
8 RP11-282M7 C 8q22.2(FHCRC)
chr8 99Mb   SHGC-3301 AQ503733.1 T7,
AQ503730.1 SP6
 
8 RP11-49P16 C 8q22.2~22.3(FHCRC)
chr4 150Mb   SHGC4-896 AQ116299.1  
8 CTB-4M12 R 8q22.3(CSMC)
chr8 106Mb   AFMB340XF5, AFM343XA5    
8 RP11-118J17 R 8q22.3b(NCI)
chr8 102Mb AC011028.11   AQ348517.1 SP6,
AQ348519.1 T7
 
8 CTD-2013D21 C 8q23.1(FHCRC)
chr8 110Mb     AQ221670.1 T7,
AQ900520.1 T7,
AQ223642.1*u SP6
 
8 RP11-81B5 C 8q23.1(FHCRC)
chr8 108Mb AC083966.3   AQ280950.1 SP6,
AZ521494.1 SP6,
AZ521496.1 T7,
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8 RP11-680F3 C 8q23(FHCRC)
chr8 104Mb AC025936.3      
8 RP11-762A3 C 8q23(FHCRC)
chr8 116Mb     AQ454238.1 T7,
AQ619997.1 SP6
 
8 RP11-79C21 C 8q23(FHCRC)
chr8 109Mb     AZ520700.1 SP6,
AQ282271.1 SP6,
AQ282273.1 T7
 
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chr8 110Mb     AZ520702.1 SP6,
AQ282275.1 SP6,
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AQ282277.1 T7
 
8 RP11-79F7 CR 8q23(FHCRC)
8q23.1c(NCI)
chr8 107Mb AF303733.2, AC091145.2*u   AQ284146.1 T7,
AQ284144.1 SP6
 
8 RP11-79O20 C 8q23(FHCRC)
chr8 110Mb AC087435.5   AQ283333.1 T7,
AQ283332.1 SP6
 
8 RP11-80D8 C 8q23(FHCRC)
chr8 109Mb AC083931.4   AQ283968.1 T7,
AQ283966.1 SP6
 
8 RP11-88L22 C 8q23(FHCRC)
chr8 113Mb AC044856.2*u   AQ281516.1 SP6,
AQ281519.1 T7
 
8 RP11-89I16 C 8q23(FHCRC)
chr8 114Mb     AQ282907.1 SP6,
AZ517211.1 SP6,
AQ282908.1 T7
 
8 RP11-91F1 C 8q23(FHCRC)
chr8 110Mb     AZ519282.1 T7,
AQ283313.1 T7
 
8 RP11-91K1 C 8q23(FHCRC)
chr8 110Mb AC083926.2*u   AQ281497.1 SP6,
AQ281500.1 T7
 
8 CTD-2005M12 C 8q23~24.1(FHCRC)
chr8 118Mb     AQ803900.1 T7,
B56021.1 ,
B56022.1 SP6
 
8 RP11-22P7 R 8q23.1d(NCI)
chr8 109Mb AC020991.4   AQ014311.1 ,
B84276.1 T7,
B84275.1 SP6
 
8 RP11-25D10 R 8q23.2a(NCI)
chr8 110Mb AC023245.5   B83177.1 T7,
AQ013603.1 ,
AQ013605.1 ,
AQ003398.1 SP6
 
8 RP11-89P19 C 8q23.3(FHCRC)
chr8 119Mb AC087845.4   AQ285664.1 T7,
AQ285663.1 SP6
 
8 RP11-88J18 C 8q23.3~24.1(FHCRC)
chr8 122Mb AC090034.2   AQ281007.1 T7,
AZ516287.1 T7,
AQ281004.1 SP6
 
Chr clone name Distributor1 FISH Placement on genome2 Placement summary3 Insert sequence4 STS4 BAC-ends4 Flag
8 RP11-3A12 R 8q23.3c(NCI)
chr8 113Mb AC007719.7   B48714.1 T7,
B48713.1 SP6
 
8 RP11-393K19 R 8q23.3e(NCI)
chr8 115Mb AC025881.6      
8 RP11-30P9 R 8q24.11a(NCI)
chr8 118Mb AC024329.9   B85274.1 T7,
B85273.1 SP6
 
8 CTB-12C12 R 8q24.1(CSMC)
chr8 129Mb   AFMA197WG5    
8 CTB-14M16 R 8q24.1(CSMC)
chr8 130Mb   AFMA084ZD1    
8 CTB-17K9 R 8q24.1(CSMC)
chr8 130Mb   AFM287YE1    
8 CTB-1J13 R 8q24.1(CSMC)
chr8 134Mb   AFMB001WA9    
8 CTB-49G22 R 8q24.1(CSMC)
chr8 122Mb   AFM182YA3    
8 CTB-66M2 R 8q24.1(CSMC)
chr8 123Mb   AFMA239ZC1    
8 CTB-9N19 R 8q24.1(CSMC)
chr8 130Mb   AFM287YE1    
8 CTD-2092I19 C 8q24.1(FHCRC)
chr8 121Mb   Hs.95011    
8 RP11-110D15 C 8q24.1(FHCRC)
chr8 125Mb AC011004.12,
AC091575.2
SHGC-20514 AQ318054.1 T7,
AQ350257.1 SP6
 
8 RP11-128G18 C 8q24.1(FHCRC)
chr8 127Mb   SHGC-20519    
8 RP11-142P5 C 8q24.1(FHCRC)
chr8 126Mb   SHGC-775 AQ387129.1 T7,
AQ387127.1 SP6
 
8 RP11-145G10 C 8q24.1(FHCRC)
chr8 128Mb   SHGC-6067    
8 RP11-150N13 C 8q24.1(FHCRC)
chr8 126Mb   SHGC-33154 AQ374892.1 T7,
AQ374890.1 SP6
 
8 RP11-158K1 C 8q24.1(FHCRC)
chr8 125Mb AC090198.7,
AF313041.4
SHGC-324, SHGC-20514    
8 RP11-44N11 C 8q24.1(FHCRC)
chr8 123Mb AC016405.8 AFMA059WA9 AQ200010.1 ,
AQ200009.1
 
8 RP11-495D4 C 8q24.1(FHCRC)
chr8 126Mb AC019218.3,
AC091562.5,
AF252829.4
AFM151YE3    
8 RP11-89K10 C 8q24.1(FHCRC)
chr8 127Mb AC083923.5 SHGC-20519 AQ282945.1 T7,
AQ282934.1 SP6
 
8 RP11-89P9 C 8q24.1(FHCRC)
chr8 125Mb AC133329.4   AQ285643.1 SP6,
AQ285644.1 T7
 
8 RP11-91M23 C 8q24.1(FHCRC)
chr8 125Mb     AQ282482.1 SP6,
AQ282485.1 T7
 
8 RP11-99I9 C 8q24.1(FHCRC)
chr8 120Mb AC016660.11,
AC099818.2
AFM156XC3 AQ321528.1 SP6,
AQ321539.1 T7
 
8 RP11-183L11 C 8q24.1~24.2(FHCRC)
chr8 133Mb   SHGC-32596 AQ419003.1 T7  
8 RP11-79E8 C 8q24.1~24.2(FHCRC)
chr8 130Mb AC084689.2   AQ581313.1 SP6,
AZ519156.1 SP6,
AQ282590.1 SP6,
AQ581329.1 T7,
AQ282593.1 T7
 
8 RP11-89L16 C 8q24.1~24.2(FHCRC)
chr8 129Mb AC087044.3   AQ286607.1 T7,
AQ286605.1*u SP6
 
8 RP11-90G11 C 8q24.1~24.2(FHCRC)
chr8 127Mb   SHGC-20519 AQ281610.1 SP6,
AQ281614.1 T7
 
8 RP11-94M13 C 8q24.1~24.2(FHCRC)
chr8 132Mb   SHGC-36664 AQ313845.1 T7,
AQ313844.1 SP6
 
8 RP11-229L23 C 8q24.12~24.2(FHCRC)
chr8 125Mb   SHGC-324, SHGC-20514    
8 RP11-534K13 R 8q24.12b(NCI)
chr8 121Mb AC020603.4, AC087751.1*u      
8 RP11-468O2 R 8q24.13a(NCI)
chr8 124Mb AC018992.6   AQ631716.1 T7  
8 CTB-56D16 R 8q24.2(CSMC)
chr8 139Mb   AFMA083WG1    
8 CTD-2118N15 C 8q24.2(FHCRC)
chr8 37Mb     AQ567626.1 T7  
8 RP11-122H7 C 8q24.2(FHCRC)
chr8 138Mb AC079002.2*u SHGC-33759 AQ383841.1 SP6,
AQ343608.1 T7
 
8 RP11-128P9 C 8q24.2(FHCRC)
chr8 133Mb   SHGC-1969    
8 RP11-158G1 C 8q24.2(FHCRC)
chr8 133Mb   SHGC-582, SHGC-582*u    
8 RP11-17M8 C 8q24.2(FHCRC)
chr8 137Mb AC013646.6 AFM175XB4 B81866.1 SP6,
B82798.1 T7
 
8 RP11-184M21 C 8q24.2(FHCRC)
chr8 134Mb AC090798.2 SHGC-1948 AQ420472.1 SP6,
AQ420475.1 T7
 
8 RP11-189E11 C 8q24.2(FHCRC)
chr8 135Mb   SHGC-13621 AQ421600.1 SP6  
8 RP11-21H16 C 8q24.2(FHCRC)
chr8 135Mb AC084813.1 SHGC-1965 AQ008864.1 T7,
B85922.1 SP6
 
8 RP11-227F7 C 8q24.2(FHCRC)
chr8 131Mb   SHGC-36267    
8 RP11-237F24 C 8q24.2(FHCRC)
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8 RP11-240B13 C 8q24.2(FHCRC)
chr8 132Mb AC092817.2   AQ482531.1 T7,
AQ482528.1 SP6
 
8 RP11-28A4 C 8q24.2(FHCRC)
chr8 136Mb   SHGC-6384 B84756.1 T7,
B84755.1 SP6
 
8 RP11-316E19 C 8q24.2(FHCRC)
chr8 134Mb AC079020.2   AQ506072.1 T7,
AQ506070.1 SP6
 
8 RP11-45B19 C 8q24.2(FHCRC)
chr8 135Mb AC015599.5 AFMA175XC1 AQ194540.1 ,
AQ194543.1
 
8 RP11-65D17 CR 8q24.2(FHCRC)
8q24.21a(NCI)
chr8 127Mb AC087667.4,
AF188028.3
AFM203XD10, SHGC-1929 AQ193999.1 ,
AQ237145.1 SP6
 
8 RP11-88M23 C 8q24.2(FHCRC)
chr8 134Mb   SHGC-32958    
8 RP11-89E23 C 8q24.2(FHCRC)
chr8 133Mb     AQ284391.1 SP6,
AQ284397.1 T7
 
8 RP5-1111B24 S 8q24.22~24.3(SC)
chr8 146Mb AC087720.3      
8 RP11-71N3 R 8q24.22b(NCI)
chr8 133Mb AC011200.9,
AC090262.2, AC123780.2*u
  AQ237087.1 T7,
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8 RP11-489O18 R 8q24.23b(NCI)
chr8 139Mb AC079015.8   AQ633886.1 T7,
AQ633884.1 SP6
 
8 RP11-374B17 R 8q24.23c(NCI)
chr8 139Mb AC068476.13      
8 CTB-17I17 R 8q24.3(CSMC)
chr8 144Mb   WI-8705    
8 RP11-13A18 C 8q24.3(FHCRC)
chr8 141Mb   SHGC-12766 B75984.1 SP6,
B83364.1*u T7
 
8 RP11-449D3 C 8q24.3(FHCRC)
chr8 138Mb     AQ584289.1 T7,
AQ584285.1 SP6
 
8 RP11-642A1 C 8q24.3(FHCRC)
chr8 141Mb AC067931.16 AFMA119ZH1 AQ401176.1 SP6,
AQ409129.1 T7
 
8 RP11-91F24 C 8q24.3(FHCRC)
chr8 145Mb     AQ285155.1 T7,
AQ285152.1 SP6
 
8 RP11-953B20 R 8q24.3d(NCI)
chr8 142Mb AC104417.14   AQ700743.1 SP6,
AQ571424.1 T7
 
total354C:274 R:87 S:1354354 165187249 

1 Distributor: C, Children's hospical Oakland research institute; R, Research Genetics; S, Sanger Center

2 Placement of clones on the genome. Only clones that are localiized to one or two places on the same chromosome on the draft sequence are included

3 Placement summary indicates sequences used for clone placement.
   BAC-end sequence aligned in the plus orientation
   BAC-end sequence aligned in the minus orientation
   insert sequence
   STS aligned
   insert sequence has clone end information.

4 Sequence-tag

  *d indicates sequences that disagree with placement on the genome.

  *u indicates seqeunces that didn't align to the genome or were not used for annotation because the clone was placed to multiple locations on the human genome.