NCBI Logo
GEO Logo
   NCBI > GEO > Accession DisplayHelp Not logged in | LoginHelp
GEO help: Mouse over screen elements for information.
          Go
Platform GPL2641 Query DataSets for GPL2641
Status Public on Jul 18, 2005
Title [Mapping10K_Xba142] Affymetrix Human Mapping 10K 2.0 Array
Technology type in situ oligonucleotide
Distribution commercial
Organism Homo sapiens
Manufacturer Affymetrix
Manufacture protocol see manufacturer's web site
 
Description Affymetrix submissions are typically submitted to GEO using the GEOarchive method described at http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/geo/info/geo_affy.html

As with the previous-generation GeneChip® Mapping 10K Array, the GeneChip Mapping 10K 2.0 Array enables researchers to genotype more than 10,000 SNPs in a single experiment with one primer. The GeneChip Mapping 10K 2.0 Array contains equivalent content and performance as the original GeneChip Mapping 10K Array, but advances in photolithographic technology enable it to be produced in a smaller, more cost-efficient format. Now, researchers can genotype 10,000 SNPs in a single experiment at a cost comparable to microsatellite research.

Annotations derived from Affymetrix CSV file dated 6/21/2005.
 
Web link http://www.affymetrix.com/support/technical/byproduct.affx?product=10k-20
http://www.affymetrix.com/analysis/index.affx
Submission date Jul 18, 2005
Last update date Jun 03, 2009
Organization Affymetrix, Inc.
E-mail(s) geo@ncbi.nlm.nih.gov, support@affymetrix.com
Phone 888-362-2447
URL http://www.affymetrix.com/index.affx
Street address
City Santa Clara
State/province CA
ZIP/Postal code 95051
Country USA
 
Samples (8218) GSM64605, GSM64606, GSM64607, GSM64608, GSM64609, GSM64610 
Series (24)
GSE2959 Genome-wide SNP Microarray Mapping in Basal Cell Carcinomas Unveils Uniparental Disomy as a Key Somatic Event.
GSE5347 High Resolution Copy Number Analysis of Paraffin Embedded Archival Tissue Using SNP BeadArrays
GSE6754 Mapping autism risk loci using genetic linkage and chromosomal rearrangements

Data table header descriptions
ID
dbSNP RS ID refSNP ID
Chromosome
Genome Version
DB SNP Version
Physical Position
Strand
ChrX pseudo-autosomal region
Cytoband
SEQUENCE
Allele A
Allele B
Associated Gene
Genetic Map
Microsatellite
Fragment Length Start Stop
Freq Asian
Freq AfAm
Freq Cauc
Het Asian
Het AfAm
Het Cauc
Num chrm Asian
Num chrm AfAm
Num chrm Cauc
SPOT_ID

Data table
ID dbSNP RS ID Chromosome Genome Version DB SNP Version Physical Position Strand ChrX pseudo-autosomal region Cytoband SEQUENCE Allele A Allele B Associated Gene Genetic Map Microsatellite Fragment Length Start Stop Freq Asian Freq AfAm Freq Cauc Het Asian Het AfAm Het Cauc Num chrm Asian Num chrm AfAm Num chrm Cauc SPOT_ID
SNP_A-1513639 rs2252534 8 NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 11422122 + FALSE p23.1 agactatacaaaactc[A/C]atacccttcaatggct A C NM_001715 // intron // 0 // Hs.146591 // BLK // 640 // Homo sapiens B lymphoid tyrosine kinase (BLK), mRNA. /// ENST00000259089 // intron // 0 // --- // --- // --- // --- 15.1113448049531 // D8S1106 // 21.8080386907638 // --- // --- /// 21.3240979868872 // D8S1825 // D8S1130 // AFMA055ZG1 // GATA25C10 /// 24.366025065158 // D8S503 // --- // --- // 781126 D8S1759 // upstream // 92927 /// D8S1695 // downstream // 35044 299 // 11422055 // 11422353 1.0 // 0.0 0.952 // 0.048 0.774 // 0.226 0 0.091 0.35 40 84 84
SNP_A-1508288 rs2866121 3 NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 119902778 - FALSE q13.32 tgcatgattctttctt[G/T]cacccaagattttctc G T NM_152538 // downstream // 200913 // Hs.112873 // IGSF11 // 152404 // Homo sapiens immunoglobulin superfamily, member 11 (IGSF11), mRNA. /// ENST00000354673 // downstream // 200913 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000359893 // upstream // 2054901 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000273382 // downstream // 199393 // --- // --- // --- // --- 159.642054651887 // D3S3664 // 126.333815782075 // --- // --- /// 136.106436573467 // D3S3649 // D3S3515 // AFMB322ZF1 // AFM308VE9 /// 124.817537270881 // --- // --- // 564387 // 86205 D3S3515 // upstream // 112713 /// D3S3703 // downstream // 87481 428 // 119902461 // 119902888 0.55 // 0.45 0.603 // 0.397 0.464 // 0.536 0.495 0.479 0.497 40 78 84
SNP_A-1510088 rs2889274 9 NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 74102182 - FALSE q21.13 gaacaagaaccagtga[A/G]aacataaacagactga A G NM_000700 // downstream // 1087321 // Hs.494173 // ANXA1 // 301 // Homo sapiens annexin A1 (ANXA1), mRNA. /// ENST00000360687 // upstream // 239636 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000354796 // upstream // 239636 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000257497 // downstream // 1087321 // --- // --- // --- // --- 82.4611603492832 // D9S175 // 68.9983412200348 // --- // --- /// 69.5742602078934 // D9S1124 // D9S1860 // GGAA20D07 // AFMC007XG9 /// 73.4802234240977 // --- // --- // 840888 // 605449 D9S2009 // upstream // 403443 /// D9S1084 // downstream // 86889 884 // 74102123 // 74103006 0.15 // 0.85 0.631 // 0.369 0.357 // 0.643 0.255 0.466 0.459 40 84 84
SNP_A-1517381 rs2834520 21 NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 34840226 + FALSE q22.12 agaaatgttgaaggac[A/G]tcagtcaatctttaat A G NM_004414 // intron // 0 // Hs.282326 // DSCR1 // 1827 // Homo sapiens Down syndrome critical region gene 1 (DSCR1), transcript variant 1, mRNA. /// NM_203418 // intron // 0 // Hs.282326 // DSCR1 // 1827 // Homo sapiens Down syndrome critical region gene 1 (DSCR1), transcript variant 3, mRNA. /// NM_203417 // intron // 0 // Hs.282326 // DSCR1 // 1827 // Homo sapiens Down syndrome critical region gene 1 (DSCR1), transcript variant 2, mRNA. /// ENST00000313806 // intron // 0 // --- // --- // --- // --- 55.9697387946788 // D21S1894 // 39.9436721691419 // --- // --- /// 32.5541388804211 // D21S1920 // D21S1921 // AFMA086YF9 // AFMA099WC9 /// 33.9333471126047 // D21S1920 // D21S65 // --- // --- D21S331 // upstream // 50851 /// D21S1707 // downstream // 103186 618 // 34839851 // 34840468 0.6 // 0.4 0.607 // 0.393 0.869 // 0.131 0.48 0.477 0.228 40 84 84
SNP_A-1517025 rs2888038 2 NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 212777303 + FALSE q34 gatgcagagaaaggga[C/G]cttaaaaagatcatct C G NM_005235 // intron // 0 // Hs.390729 // ERBB4 // 2066 // Homo sapiens v-erb-a erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 4 (avian) (ERBB4), mRNA. /// ENST00000342788 // intron // 0 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000260943 // intron // 0 // --- // --- // --- // --- 270.763063630443 // D2S2322 // 208.282823771991 // --- // --- /// 207.728629750169 // D2S371 // D2S317 // AFM311VG9 // AFM094XF11 /// 194.442955971085 // --- // D2S317 // 65287 // --- D2S317 // upstream // 549757 /// D2S1749 // downstream // 202528 768 // 212777146 // 212777913 1.0 // 0.0 0.632 // 0.368 0.929 // 0.071 0 0.465 0.133 40 76 84
SNP_A-1508121 rs2437871 10 NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 90268360 + FALSE q23.31 cacatgatcaaataca[A/C]acagatggaaagctaa A C NM_018363 // intron // 0 // Hs.149849 // C10orf59 // 55328 // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 59 (C10orf59), mRNA. /// ENST00000328997 // intron // 0 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000331772 // intron // 0 // --- // --- // --- // --- 137.737942661397 // D10S1739 // 108.297343720867 // --- // --- /// 109.137882306908 // D10S1765 // D10S1735 // AFM337XF9 // AFM269XF9 /// 103.109695406719 // D10S608 // --- // --- // 466126 D10S1411 // upstream // 160396 /// D10S2339 // downstream // 189798 739 // 90267809 // 90268547 0.325 // 0.675 0.548 // 0.452 0.452 // 0.548 0.439 0.495 0.495 40 84 84
SNP_A-1511541 rs2873016 X NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 79286346 - FALSE q21.1 acaccaaattgtacaa[C/G]tatccatgcaaaagac C G NM_152630 // upstream // 195745 // Hs.367959 // FAM46D // 169966 // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member D (FAM46D), mRNA. /// NM_152630 // upstream // 110802 // Hs.367959 // FAM46D // 169966 // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member D (FAM46D), mRNA. /// NM_016954 // downstream // 192933 // Hs.374253 // TBX22 // 50945 // Homo sapiens T-box 22 (TBX22), mRNA. /// ENST00000308293 // upstream // 195745 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000341891 // upstream // 110802 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000241607 // downstream // 192933 // --- // --- // --- // --- 86.853110038526 // DXS8076 // 86.853110038526 // --- // --- /// 57.2240062430872 // DXS8046 // DXS6793 // AFM205XE9 // ATA14A02 /// 63.9689888719808 // --- // --- // 639658 // 56484 DXS7922 // upstream // 353680 /// DXS986 // downstream // 99172 955 // 79285587 // 79286541 1.0 // 0.0 0.846 // 0.154 1.0 // 0.0 0 0.26 0 40 78 84
SNP_A-1515886 rs2280415 1 NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 157619684 + FALSE q23.3 aggtatttcatgctgc[C/T]ggccactgaaagcata C T NM_016382 // intron // 0 // Hs.157872 // CD244 // 51744 // Homo sapiens CD244 natural killer cell receptor 2B4 (CD244), mRNA. /// ENST00000322302 // intron // 0 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000263289 // intron // 0 // --- // --- // --- // --- 206.42567315095 // D1S2705 // 157.308328404058 // --- // --- /// 169.709979160539 // D1S484 // D1S1679 // AFM297WB9 // GGAA5F09 /// 160.206338359429 // --- // --- // 60443 // 152423 D1S2348 // upstream // 5291 /// D1S484 // downstream // 39301 420 // 157619512 // 157619931 0.6 // 0.4 0.583 // 0.417 0.429 // 0.571 0.48 0.486 0.49 40 84 84
SNP_A-1515092 rs2890905 5 NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 175289072 + FALSE q35.2 cgaggcaacaggaact[C/G]tcaggaactctcattt C G NM_006651 // downstream // 49418 // Hs.478930 // CPLX1 // 10815 // Homo sapiens complexin 1 (CPLX1), mRNA. /// NM_006650 // downstream // 49418 // Hs.534389 // CPLX2 // 10814 // Homo sapiens complexin 2 (CPLX2), mRNA. /// NM_032361 // downstream // 30070 // Hs.484227 // THOC3 // 84321 // Homo sapiens THO complex 3 (THOC3), mRNA. /// NM_006651 // downstream // 49235 // Hs.478930 // CPLX1 // 10815 // Homo sapiens complexin 1 (CPLX1), mRNA. /// NM_006650 // downstream // 49235 // Hs.534389 // CPLX2 // 10814 // Homo sapiens complexin 2 (CPLX2), mRNA. /// ENST00000358943 // downstream // 49418 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000274615 // downstream // 45443 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000265097 // downstream // 30070 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000359546 // downstream // 49235 // --- // --- // --- // --- 254.974260420764 // D5S469 // 195.579496890992 // --- // --- /// 186.841716711897 // D5S498 // D5S2111 // AFM238XE11 // AFMA083WC5 /// 182.065139185039 // --- // D5S2111 // 471944 // --- D5S439E // upstream // 544909 /// D5S1398 // downstream // 37849 596 // 175288527 // 175289122 0.4 // 0.6 0.905 // 0.095 0.631 // 0.369 0.48 0.172 0.466 40 84 84
SNP_A-1517974 rs2411320 19 NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 56593251 - FALSE q13.41 ctccctggaactgata[A/T]tttgaacaagacagcc A T NM_030657 // upstream // 10242 // Hs.162754 // LIM2 // 3982 // Homo sapiens lens intrinsic membrane protein 2, 19kDa (LIM2), mRNA. /// NM_033130 // downstream // 12869 // Hs.284813 // SIGLEC10 // 89790 // Homo sapiens sialic acid binding Ig-like lectin 10 (SIGLEC10), mRNA. /// ENST00000353836 // downstream // 11837 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000221973 // upstream // 10242 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000339313 // downstream // 12869 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000270591 // downstream // 11837 // --- // --- // --- // --- 112.792479848313 // D19S601 // 87.6646063553665 // --- // --- /// 81.7707524562479 // D19S553 // D19S397 // UT6196 // UT963 /// 78.2625134633016 // --- // D19S888 // 53228 // --- D19S402 // upstream // 268342 /// D1S3202 // downstream // 158496 576 // 56592775 // 56593350 0.6 // 0.4 0.548 // 0.452 0.881 // 0.119 0.48 0.495 0.21 40 84 84
SNP_A-1509540 rs2421611 2 NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 117043179 + FALSE q14.1 tagaatttagtagtga[C/T]gccattaggtcttggg C T NM_006773 // upstream // 1245306 // Hs.363492 // DDX18 // 8886 // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 18 (DDX18), mRNA. /// NM_001004360 // downstream // 726473 // Hs.176247 // DPP10 // 57628 // Homo sapiens dipeptidylpeptidase 10 (DPP10), transcript variant 2, mRNA. /// NM_020868 // downstream // 726473 // Hs.176247 // DPP10 // 57628 // Homo sapiens dipeptidylpeptidase 10 (DPP10), transcript variant 1, mRNA. /// ENST00000263239 // upstream // 1245306 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000310323 // downstream // 726473 // --- // --- // --- // --- 164.473471193483 // D2S1277 // 127.93430709887 // --- // --- /// 125.85375115678 // D2S121 // UNKNOWN // AFM087XA1 // GATA167A05 /// 119.246426890616 // --- // D2S437 // 46795 // --- D2S1771 // upstream // 14283 /// D13S974 // downstream // 315052 642 // 117042672 // 117043313 0.975 // 0.025 0.75 // 0.25 0.679 // 0.321 0.049 0.375 0.436 40 84 84
SNP_A-1516351 rs4418557 1 NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 178714618 + FALSE q25.3 cagaaacatgtgtaga[A/C]gtctccttggtttttt A C NM_002065 // downstream // 369072 // Hs.518525 // GLUL // 2752 // Homo sapiens glutamate-ammonia ligase (glutamine synthase) (GLUL), mRNA. /// NM_000721 // downstream // 214880 // Hs.437444 // CACNA1E // 777 // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, alpha 1E subunit (CACNA1E), mRNA. /// L27745 // downstream // 214866 // Hs.437444 // CACNA1E // 777 // Homo sapiens voltage-operated calcium channel, alpha-1 subunit mRNA, complete cds. /// NM_002065 // downstream // 369077 // Hs.518525 // GLUL // 2752 // Homo sapiens glutamate-ammonia ligase (glutamine synthase) (GLUL), mRNA. /// ENST00000311223 // downstream // 369072 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000360108 // downstream // 214880 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000357570 // downstream // 214866 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000358338 // downstream // 214880 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000339526 // downstream // 369077 // --- // --- // --- // --- 236.909432594719 // D1S2619 // 182.812267180811 // --- // --- /// 196.884926917198 // D1S2640 // D1S2623 // AFMA143WD5 // AFMA116YC5 /// 182.580031648219 // --- // --- // 617186 // 992065 D1S2619 // upstream // 293099 /// D1S2559 // downstream // 44643 601 // 178714281 // 178714881 1.0 // 0.0 0.94 // 0.06 0.619 // 0.381 0 0.112 0.472 40 84 84
SNP_A-1508710 rs1769621 14 NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 33493429 + FALSE q13.1 aattacagcaacattg[C/T]cttccagtgtgcatct C T NM_138288 // downstream // 478476 // Hs.269909 // C14orf147 // 171546 // Homo sapiens chromosome 14 open reading frame 147 (C14orf147), mRNA. /// NM_022073 // upstream // 3392 // Hs.135507 // EGLN3 // 112399 // Homo sapiens egl nine homolog 3 (C. elegans) (EGLN3), mRNA. /// ENST00000298130 // downstream // 478476 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000250457 // upstream // 3392 // --- // --- // --- // --- 32.4063444232555 // D14S70 // 36.2411360494545 // --- // --- /// 39.9160397814425 // D14S1060 // D14S70 // AFMA053WE9 // AFM191VE1 /// 34.9347222790717 // --- // --- // 1041131 // 286420 D14S70 // upstream // 35515 /// D14S626 // downstream // 172382 866 // 33493041 // 33493906 0.5 // 0.5 0.714 // 0.286 0.75 // 0.25 0.5 0.408 0.375 40 84 84
SNP_A-1513399 rs2410220 21 NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 40484883 + FALSE q22.2 cttgattgcttgcctc[A/G]taagacttccaaggta A G NM_206887 // intron // 0 // Hs.397800 // DSCAM // 1826 // Homo sapiens Down syndrome cell adhesion molecule (DSCAM), transcript variant 2, mRNA. /// NM_001389 // intron // 0 // Hs.397800 // DSCAM // 1826 // Homo sapiens Down syndrome cell adhesion molecule (DSCAM), transcript variant 1, mRNA. /// ENST00000304537 // intron // 0 // --- // --- // --- // --- 68.4407896120241 // D21S1906 // 52.5573899414229 // --- // --- /// 44.3709010211074 // D21S1893 // D21S1889 // AFM206ZC7 // AFMA230YD1 /// 40.9474065506883 // --- // D21S1889 // 46810 // --- D21S1889 // upstream // 261765 /// D21S1806 // downstream // 58722 557 // 40484506 // 40485062 0.0 // 1.0 0.286 // 0.714 0.012 // 0.988 0 0.408 0.024 40 84 84
SNP_A-1512764 rs2864461 7 NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 66663771 + FALSE q11.22 aaagcagttcaacagt[C/G]aaaagacaggtttatt C G NM_015570 // upstream // 1845520 // Hs.21631 // AUTS2 // 26053 // Homo sapiens autism susceptibility candidate 2 (AUTS2), mRNA. /// ENST00000345497 // upstream // 1845520 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000353285 // downstream // 433108 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000342771 // upstream // 1845520 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000352103 // downstream // 433108 // --- // --- // --- // --- 101.855387258923 // D7S482 // 79.1963175982105 // --- // --- /// 78.353380902164 // D7S2549 // D7S2483 // AFMA055XG9 // AFMB286XD5 /// 69.9394163699115 // --- // --- // 49536 // 56407 D7S482 // upstream // 50308 /// D7S1504 // downstream // 1729 548 // 66663674 // 66664221 0.15 // 0.85 0.44 // 0.56 0.19 // 0.81 0.255 0.493 0.308 40 84 84
SNP_A-1516154 rs2888378 12 NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 97978643 + FALSE q23.1 ggagcaagtgtatgaa[A/G]ttctgaaggaagggct A G NM_020140 // intron // 0 // Hs.506458 // EB-1 // 56899 // Homo sapiens E2a-Pbx1-associated protein (EB-1), transcript variant 3, mRNA. /// NM_152788 // intron // 0 // Hs.506458 // EB-1 // 56899 // Homo sapiens E2a-Pbx1-associated protein (EB-1), transcript variant 1, mRNA. /// NM_181670 // intron // 0 // Hs.506458 // EB-1 // 56899 // Homo sapiens E2a-Pbx1-associated protein (EB-1), transcript variant 2, mRNA. /// ENST00000332712 // intron // 0 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000329257 // intron // 0 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000333732 // intron // 0 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000341752 // intron // 0 // --- // --- // --- // --- 136.59 // D12S346 // 110.967169007583 // --- // --- /// 104.293209387822 // D12S1716 // D12S1041 // AFMA065YD5 // ATA24F01 /// 104.159656599712 // --- // D12S1059 // 46303 // --- D12S2043 // upstream // 48372 /// D5S1886 // downstream // 12688 571 // 97978367 // 97978937 0.725 // 0.275 0.452 // 0.548 0.512 // 0.488 0.399 0.495 0.5 40 84 84
SNP_A-1515488 rs11186261 10 NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 92412933 + FALSE q23.31 caccactttaatctac[A/G]taacactggaagtcct A G ENST00000356117 // downstream // 33079 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000277860 // downstream // 684126 // --- // --- // --- // --- 141.419970798265 // D10S564 // 110.567826568544 // --- // --- /// 112.410092481756 // D10S1143 // D10S564 // UT923 // AFM029XH12 /// 106.663609043773 // D10S1242 // --- // --- // 618459 D10S564 // upstream // 176719 /// D10S1753 // downstream // 10039 959 // 92412889 // 92413847 0.292 // 0.708 0.47 // 0.53 0.583 // 0.417 0.413 0.498 0.486 24 66 84
SNP_A-1515487 rs2417464 9 NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 103669736 + FALSE q31.1 ctaaggaggattaggt[C/T]aaaaccaacagcatag C T NM_001340 // downstream // 822221 // Hs.3232 // CYLC2 // 1539 // Homo sapiens cylicin, basic protein of sperm head cytoskeleton 2 (CYLC2), mRNA. /// NM_006444 // upstream // 266360 // Hs.119023 // SMC2L1 // 10592 // Homo sapiens SMC2 structural maintenance of chromosomes 2-like 1 (yeast) (SMC2L1), mRNA. /// ENST00000286282 // downstream // 822221 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000338409 // downstream // 822221 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000286398 // upstream // 266360 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000303219 // upstream // 266426 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000259347 // upstream // 266360 // --- // --- // --- // --- 134.274612729896 // D9S53 // 106.247203971975 // --- // --- /// 109.46533027477 // D9S1690 // D9S1866 // AFM294XC9 // AFM064XE5 /// 108.148715095965 // --- // --- // 563855 // 149563 D14S1148 // upstream // 139169 /// D9S127 // downstream // 34090 471 // 103669711 // 103670181 0.475 // 0.525 0.659 // 0.341 0.69 // 0.31 0.499 0.45 0.427 40 82 84
SNP_A-1515485 rs2889529 17 NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 74409070 - FALSE q25.3 ctccctcgttcagatt[C/T]gctccttgttcttcag C T NM_003255 // intron // 0 // Hs.104839 // TIMP2 // 7077 // Homo sapiens tissue inhibitor of metalloproteinase 2 (TIMP2), mRNA. /// ENST00000262768 // intron // 0 // --- // --- // --- // --- /// ENST00000322630 // intron // 0 // --- // --- // --- // --- 156.919061130495 // D17S1847 // 123.232617027216 // --- // --- /// 110.507445014199 // D17S802 // D17S1847 // AFM210XA5 // AFMB310YF5 /// 104.512348845467 // D17S802 // D17S1830 // --- // --- D17S1847 // upstream // 127232 /// D13S1217 // downstream // 48090 343 // 74408934 // 74409276 0.175 // 0.825 0.595 // 0.405 0.429 // 0.571 0.289 0.482 0.49 40 84 84
SNP_A-1513393 rs2893007 7 NCBI Build 35, May 2004 123, October 2004 20473928 + FALSE p21.1 gcatcagcccatgccc[A/T]cttcaatctgttctca A T NM_178559 // intron // 0 // Hs.404102 // ABCB5 // 340273 // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 5 (ABCB5), mRNA. /// ENST00000258738 // intron // 0 // --- // --- // --- // --- 38.0043321331475 // D7S2535 // 35.2245507077538 // --- // --- /// 32.5560575309067 // D7S2551 // D7S2535 // AFM107YH2 // AFM347ZB9 /// 27.2537630995494 // --- // D7S2535 // 50450 // --- D7S1802 // upstream // 4561 /// D7S1961 // downstream // 228571 509 // 20473772 // 20474280 0.95 // 0.05 0.821 // 0.179 0.905 // 0.095 0.095 0.293 0.172 40 84 84

Total number of rows: 10208

Table truncated, full table size 9270 Kbytes.




Download family Format
SOFT formatted family file(s) SOFTHelp
MINiML formatted family file(s) MINiMLHelp

Supplementary data files not provided
| NLM | NIH | GEO Help | Disclaimer | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap